Foto: Wikimedia Commons (CC0) orgel staat achter roosters in nissen aan weerszijden van het altaar en is niet zichtbaar vanuit de kerk.
Fratelli Ruffatti bouwde in 1952 een nieuw sleepladen-orgel met elektrische tractuur voor de Chiesa di Santa Croce in Padova. In 1980 is het door dezelfde firma uitgebreid. Gustavo Leorin breidde het instrument in 2013 uit tot 1437 pijpen, 32 stemmen, 2 stemmen en een vrij pedaal. Het pedaalklavier is radiaal concaaf.
Dispositie:
I – Grand’Organo: C – c4 (61 toetsen)
Principale 8′
Flauto traverso 8′
Corno di notte 8′
Salicionale 8′
Ottava 4′
Flautino di selva 4′
Decima quinta 2′
Silvestre 2′
Ripieno 5 file 1.1/3′
Sesquialtera 2 file 2.2/3′
II – Espressivo: C – c 4 (61 toetsen)
Bordone amabile 16′
Principale 8′
Bordone 8′
Gamba 8′
Flauto a camino 4′
Nazardo 2.2/3′
Silvestre 2′
Decimino 1.3/5′
Larigot 1.1/3′
Cimbalo 3 file 1′
Oboe 8′
Oficleide 8′
Coro viole 3 file 8′
Tremolo
Pedale: C – g1 (32 toetsen)
Principale violone 16′
Subbasso 16′
Bordone amabile 16′
Basso 8′
Flauto 8′
Corno dolce 8′
Prestante 4′
Ocarina 4′
Eptafono 7 file 5.1/3′